吉林大学港澳台事务办公室是我校执行涉港澳台政策，处理和协调对港澳台事务的归口管理和服务的职能部门。本办公室的主要职能是：
1.根据港澳台地区工作的特殊性，严格执行和贯彻党和国家对港澳台地区的方针、政策；
2.组织并实施全校对港澳台交流工作的发展规划，为学校提供相关咨询；
3.申报并完成上级部门的各类涉港澳台重点交流项目；
4.统筹协调全校性的与港澳台地区的交流项目，推动学校与港澳台地区教育、学术等机构建立广泛的交流合作关系；
5.为各学部、各学院、各部门开展与港澳台地区的交流合作提供信息和服务；
6.负责学校涉及港澳台地区接待活动的策划和实施；
7.统筹协调全校涉港澳台地区的学生长短期交流计划和项目；
8.协调做好港澳台地区来访学者、交换生、在读学位生的日常管理并提供服务；
9.完成学校领导交办的其他各项涉港澳台事务。